Pemimpin/rektor sangat penting bagi sebuah perguruan tinggi, keberhasilan perguruan tinggi tidak lepas dari sang pimpinan/rektor yang sangan baik dan bertanggung jawab.

Berikut ini nama-nama pejabat pimpinan / rektor universitas negeri Gorontalo dari 1963-sampai sekarang :

1. Drs. Idris Djalali - Dekan Koordinator IKIP Yogyakarta Cab. Manado di Gorontalo - 1963-1966
2. Drs. Ek. M. J. Neno - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1967-1969
3. Prof. Drs. H. Thahir A. Musa - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1969-1981
4. Prof. Drs. H. Kadir Abdussamad - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1982-1988
5. Drs. H. Husain Jusuf, M.Pd - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1989-1992
6. Prof. Dr. H. Nani Tuloli                          •Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1992-1993                        •Ketua STKIP Negeri Gorontalo - 1993 - 2001                                                           •Pj. Rektor IKIIP Negeri Gorontalo - 2001 - 2002
7. Prof. Dr. Ir. H. Nelson Pomalingo, M.Pd  Rektor IKIP Negeri Gorontalo - 2002-2004, Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2004-2010
8. Dr. H. Syamsu Qamar Badu, M.Pd - Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2010 - 2019
9. Dr. H. Eduart Wolok, ST, MT - Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2019 - 2023