Universitas Negeri Gorontalo menetapkan biaya kuliah berdasarkan jalur pendaftaran mahasiswa, ada jalur reguler dan jalur mandiri. Jalur reguler terdiri dari jalur SNMPTN dan jalur SBMTPN. Sedangkan jalur  mandiri merupakan jalur pendaftaran yang diadakan oleh pihak kampus UNG.

  Untuk jalur reguler UNG menerapkan sistem UKT/ (uang kuliah tunggal) yang didasarkan atas kemampuan ekonomi penghasilan orang tua. UKT UNG juga di kelompokkan dengan besaran biaya tergantung program studinya.

  Untuk jalur mandiri UNG menerapkan sistem pembayaran UKT persemester dan uang pangkal dengan besaran bervariasi sesuai dengan program studi.