Pada awal terbentuknya, Jurusan ini hanya mengelola satu program studi yaitu Diploma 3 Manajemen Informatika yang sudah dikelola sejak tahun 2000 dan sebelumnya dikelola oleh Program Diploma Non Kependidikan STKIP Negeri Gorontalo.

Sekarang Teknik Informatika Telah Mengelola 2 Program Sarjana Yaitu

1. Program Studi S1 Sistem Informasi2. Program Studi S1 Pendidikan Teknolgi Sistem Informasi