Program Pascasarjana Universitas Negeri Gorontalo sbb:

1. Program S2 Pendidikan Bahasa Inggris
2. Program S2 Pendidikan Kependudukan dan Lingkungan Hidup
3. Program S2 Pendidikan Matematika
4. Program S2 Pendidikan Dasar
5. Program S2 Pendidikan Biologi
6. Program S2 Pendidikan Fisika
7. Program S2 Administrasi Pendidikan
8. Program S2 Agribisnis
9. Program S2 Ilmu Kelautan dan Perikanan
10. Program S2 Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan
11. Program S2 Teknologi Pendidikan
12. Program S2 Pendidikan Ekonomi
13. Program S2 Ilmu Administrasi
14. Program S2 Ilmu Hukup
15. Program S2 Pendidikan Luar Sekolah
16. Program S2 Pendidikan  Bahasa dan Sastra Indonesia
17. Program S3 Ilmu Administrasi
18. Program S3 Ilmu Pendidikan
19. Program S3 Pendidikan Bahasa
20. Program S3 Pendidikan Ilmu Pengetahuan Alam.