Universitas Negeri Gorontalo didirikan sejak tanggal 1 September 1963 dengan nama awal Junior College yang menjadi bagian dari FKIP UNSULTENG. Kemudian di tahun 1964 mengalami perubahan status menjadi FKIP IKIP Yogyakarta cabang Manado, yang kemudian bergabung dengan IKIP Manado cabang Gorontalo pada tahun 1965. Pada tahun 1982 lembaga tersebut menjadi Fakultas di Universitas Sam Ratulangi dengan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) UNSRAT Manado di Gorontalo.

Lembaga ini akhirnya secara resmi berdiri sendiri melalui Keputusan Presiden RI No.9 tahun 1993 dengan nama Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan (STKIP) Gorontalo . kemudian pada tanggal 5 Februari STKIP Gorontalo mengalami peningkatan status menjadi Insitut Keguruan dan Ilmu pendidikan (IKIP),Sebelum akhirnya diresmikan menjadi Universitas Negeri Gorontalo oleh Presiden Megawati di tanggal 23 juni 2004.

Berdasarkan hasil akreditas institusi oleh Badan Akreditas Perguruan Tinggi tahun 2018, mengukuhkan Universitas Negeri Gorontalo masuk sebagai jajaran tinggi terbaik dengan perolehan akreditas A. Pada tahun 2017, Universitas Negeri Gorontalo berada di peringkat 50 dari peringkat 100 Perguruan Tinggi Indonesia Non Politeknik dan Kementrian riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi (Kemristekditi) Republik Indonesia. Selain itu, berdasarkan peringkat Universitas di Dunia Versi Webometrics tahun 2018, menempatkan Universitas  Negeri Gorontalo pada peringkat 154 (Asia Tenggara).