Universitas Negeri Gorontalo memiliki 10 fakultas, yaitu:

Fakultas Ilmu Pendidikan

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam

Fakultas Ilmu Sosial

Fakultas Sastra dan Budaya

Fakultas Teknik

Fakultas Pertanian

Fakultas Ilmu Olahraga dan Kesehatan

Fakultas Ekonomi

Fakultas Hukum

Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan

Secara rinci nama pejabat pimpinan sejak tahun 1963 – sampai sekarang sbb :

Drs. Idris Djalali - Dekan Koordinator IKIP Yogyakarta Cab. Manado di Gorontalo - 1963-1966

Drs. Ek. M. J. Neno - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1967-1969

Prof. Drs. H. Thahir A. Musa - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1969-1981

Prof. Drs. H. Kadir Abdussamad - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1982-1988

Drs. H. Husain Jusuf, M.Pd - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1989-1992

Prof. Dr. H. Nani Tuloli

Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1992-1993

Ketua STKIP Negeri Gorontalo - 1993 - 2001

Pj. Rektor IKIIP Negeri Gorontalo - 2001 - 2002

Prof. Dr. Ir. H. Nelson Pomalingo, M.Pd

Rektor IKIP Negeri Gorontalo - 2002-2004

Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2004-2010

Prof. Dr. H. Syamsu Qamar Badu, M.Pd - Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2010 - sampai sekarang