Salah satu hal yang melatarbelakangi berdirinya jurusan Farmasi dikarenakan tingginya kebutuhan tenaga kefarmasian, khususnya di Provinsi Gorontalo. Kurangnya jumlah tenaga Farmasi baik di Instansi Pemerintah maupun di Sektor Swasta, menginisiasi para Stakeholder di lingkungan kampus UNG untuk memberikan solusi dengan jalan membuka Jurusan Farmasi di kampus UNG. Jurusan Farmasi UNG, merupakan Jurusan Farmasi pertama yang ada di Provinsi Gorontalo.

Farmasi di Universitas Negeri Gorontalo berdiri sejak tahun 2005, pada saat itu jurusan farmasi masih tergabung dalam Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam atau kita kenal dengan sebutan fakultas MIPA dan saat itu juga Farmasi UNG masih bekerja sama dengan Universitas Hasanudin (UNHAS) untuk menghasilkan lulusan-lulusan terbaik Farmasis di Universitas Negeri Gorontalo. Namun pada tahun 2008, jurusan farmasi sudah tidak bergabung di FMIPA melainkan di FOK. Pada tanggal 17 Maret 2008 berdasarkan SK Rektor Nomor 218/H47_A2/OT/2008 yang ditandatangani oleh Rektor UNG Prof. Dr. Nelson Pomalingo, M.Pd. Saat ini Jurusan Farmasi berada dibawah naungan Fakultas Olahraga dan Kesehatan serta dipercayakan mengelola dua Program Studi yakni S-1 Farmasi dan D-III Farmasi. Jurusan Farmasi di Universitas Negeri Gorontalo sudah terakreditasi B, dengan dosen pengajar yang luar biasa, yang berlatar belakang Praktisi dari berbagai Instansi baik di dinas kesehatan, rumah sakit serta industri Farmasi yang berada di Provinsi Gorontalo. yang seluruhnya berkualifikasi S2 atau S3 dengan bidang kepakaran yang beragam, dari Farmakologi, Farmasi Komunitas, Tekhnologi Farmasi, Biologi Farmasi dan Kimia Farmasi.

Farmasi UNG Gorontalo yang merupakan Pioner pencetak tenaga ahli kefarmasian pertama di provinsi Gorontalo akan terus berupaya untuk menghasilkan lulusan yang berkualitas. Selain daripada itu, Farmasi UNG juga terus berkontribusi di dunia kesehatan, melalui inovasi-inovasi di bidang Penelitian dan Pengabdian Masyarakat.

Adapun yang menjadi Visi dan Misi Jurusan Farmasi adalah :

Visi :

Menjadi jurusan yang berkarakter, kompetitif, inovatif, berbudaya di kawasan AsiaTenggara dalam bidang kefarmasian pada tahun 2035.

Misi :

1. Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran yang berkarakter dan inovatif dalam bidang kefarmasian

2. Menyelenggarakan penelitian yang inovatif dalam bidang kefarmasian yang berskala nasional dan internasional

3. Menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat dengan mengaplikasikan ilmu kefarmasian