Dalam perjalanannya selama 57 tahun telah mengalami tujuh kali pergantian pimpinan. Secara rinci, nama pejabat pimpinan sejak tahun 1963 – sampai sekarang sbb :

1. Drs. Idris Djalali - Dekan Koordinator IKIP Yogyakarta Cab. Manado di Gorontalo - 1963-1966

2. Drs. Ek. M. J. Neno - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1967-1969

3. Prof. Drs. H. Thahir A. Musa - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1969-1981

4. Prof. Drs. H. Kadir Abdussamad - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1982-1988

5. Drs. H. Husain Jusuf, M.Pd - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1989-1992

6. Prof. Dr. H. Nani Tuloli

     - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo 1992-1993

     - Ketua STKIP Negeri Gorontalo 1993 - 2001

     - Pj. Rektor IKIIP Negeri Gorontalo 2001 - 2002

7. Prof. Dr. Ir. H. Nelson Pomalingo, M.Pd  

     - Rektor IKIP Negeri Gorontalo 2002-2004

     - Rektor Universitas Negeri Gorontalo 2004-2010

8. Dr. H. Syamsu Qamar Badu, M.Pd - Rektor Universitas Negeri Gorontalo 2010-2019

9. Dr. H. Eduart Wolok, ST, MT - Rektor Universitas Negeri Gorontalo 2019-2023