Ilmu Ekonomi Politik bisa dianggap sebagai disiplin ilmu “baru” dan bisa juga disebut sudah “tua”. Disebut baru, sebab di Indonesia kenyataanya Ilmu Ekonomi Politik memang baru diajarkan dalam dua dekade terakhir. Tetapi jika diperhatikan dari latar belakang sejarah, sebenarnya disiplin Ekonomi Politik ini sudah sangat tua. Yang jelas, hubungan Ekonomi dan Politik ini sudah dibahas oleh filsuf Yunani Kuno seperti Aristoteles. Pembahasan dan pengaplikasian Ekonomi Politik lebih berkembang pada abad ke-14, saat terjadinya transisi dari kekuasaan raja kepada kaum saudagar, yang lebih dikenal dengan era merkantilisme.

Pada masa Klasik, antara Ilmu Ekonomi dengan Ilmu Politik masih menyatu. Tetapi kemudian ditangan tokoh-tokoh Eknomi Neoklasik tahun 1810-1858. Dilihat dari model Ekonomi Politik Baru dapat disimpulkan bahwa terpisahnya Ilmu Ekonomi dengan Ilmu politik dimasa lalu hanya karena pakar-pakar ekonomi murni pada periode-periode sebelumnya lebih sibuk dengan fenomena, transaksi , dan penataan pasar, tetapi tidak atau kurang mau terlibat dalam memperhatikan fenomena, transaksi, dan penataan nonpasar.Ekonomi yang berasal dari teori politik (the economic theory of politics). Dengan demikian mengglobalnya perekonomian, banyaknya campur tangan lembaga-lembaga keuangan internasional seperti IMF dan Bank Dunia, diagendakanya perekonomian global oleh WTO, serta banyaknya keterlibatan perusahaan-perusahaan multinasional dari negara-negara maju yang didukung oleh negara masing-masing semuanya karena pengaruh Neoliberalisme maka ekonomi tidak bisa lagi dipisahkan dengan politik.