Makna di balik logo UNG yaitu: 

1. kurva segi lima sama sisi adalah ornamen khas daerah Gorontalo melambangkan lama sila dari dasar negara pancasila yang menjadi azas UNG, serta lima sendi peradaban Gorontalo yang disebut (Payu, limo to Talu, LipuPei Hulalu)

2. Kerangka bunga teratai yang telah mekar penuh mengandung harapan UNG akan menghasilkan SDM yang utuh dan berkualitas.

3. Lingkungan bola dunia melambangkan komitmen untuk mencapai visi, misi dan tujuan UNG, sedangkan warna biru melambangkan keamanan dan perdamaian.

4. Buku berwarna putih yang tebuka memiliki makna sika tebuka dan semangat yang tinggi untuk mengembangkan ilmu pengetahuani, teknologi, seni budaya. 

5. Pena berbentuk ornamen lima mata melambangkan antara ilmu agama, ilmu pengetahuan, teknologi, seni dan budaya merupakan satu kesatuan yang utuh dalam duni pendidikan.

6. Mahkota raja berwarna hitam denga hiasan kuning emas melambangkan kebudayaan, keteguna dan kejayaan suatu mertabat. 23 butir emas melambangkan hari bersejarah masyatrakat gorontalo, diman tanggal 2 januari 1942 sebagai hari kemerdekanaan masyarakat gorontalo dan sekaligusn tanggal 23 juni 2004 hari peresmian UNG oleh Presiden RI.

7. Sayap burung Maleo berwarna jingga melambangkan semangat juang yang tinggi serta gerakan dinamis civitas akademika dalam menegmbangkan UNG