Universitas Negeri Gorontalo menetapkan biaya kuliah berdasarkan jalur pendaftaran mahasiswa, ada jalur reguler  dan jalur mandiri. Jalur reguler terdiri dari jalur SNMPTN dan jalur SBMPTN. Sedangkan jalur mandiri merupakan jalur pendaftaran yang diadakan oleh pihak UNG.

  Untuk jalur reguler Universitas Negeri Gorontalo menerapkan sistem UKT ( Uang Kuliah Tunggal ) yang didasarkan atas kemampuan ekonomi / penghasilan orang tua. Besaran UKT juga di dasarkan pada program studi.

Untuk jalur mandiri Universitas Negeri Gorontalo menerapkan sistem pembayaran UKT persemester dan uang pangkal dengan besaran bervariasi sesuai program studi.