Fakultas Kedokteran Universitas Negeri Gorontalo resmi didirikan dengan diserahkannya Surat Keputusan (SK) Izin Penyelenggaraan Program Studi Kedokteran oleh Menteri Riset Teknologi dan Pendidikan Tinggi Mohamad Nasir  kepada Rektor UNG Syamsu Qamar Badu di Kampus UNG pada 24 Januari 2019. Menteri Nasir menjelaskan, penyerahan izin penyelenggaraan prodi kedokteran merupakan upaya Kemenristekdikti untuk meningkatkan pelayanan kesehatan di wilayah Gorontalo.

Sebagai upaya peningkatan kualitas mahasiswa, UNG dibantu penuh oleh sejumlah dokter spesialis sebagai dosen pengajar dalam meningkatkan standarisasi kelulusan di Fakultas Kedokteran. Selain itu, upaya peningkatan mutu pendidikan bagi mahasiswa kedokteran juga dilakukan dengan membuka kerja sama pendampingan dari Universitas yang telah lebih dulu memiliki Fakultas Kedokteran yang mumpuni, seperti Universitas Hasanudin (UNHAS) Makassar.

Penerimaan mahasiswa baru Program studi Kedokteran UNG melalui 3 jalur seleksi, yaitu SNMPTN, SBMPTN, dan Mandiri (Prestasi dan CBT). Para mahasiswa baru prodi Kedokteran juga harus melakukan serangkaian tes, diantaranya tes Narkoba, tes MMPI (Minnesota Multhipasic Personality Inventory), tes Kesehatan, dan tes Wawancara.

Saat ini Fakultas Kedokteran UNG telah memasuki tahun ketiganya dan telah menerima mahasiswa baru tahun akademik 2021/2022. Seluruh mahasiswa baru telah melalui serangkaian tes yang ada dan sedang mempersiapkan PPKMB yang akan dilaksanakan pada 11 Agustus 2021 mendatang.