Fakultas Universitas Negeri Gorontalo memiliki 10 fakultas, yaitu:

Fakultas Ilmu PendidikanFakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan AlamFakultas Ilmu SosialFakultas Sastra dan BudayaFakultas TeknikFakultas PertanianFakultas Ilmu Olahraga dan KesehatanFakultas EkonomiFakultas HukumFakultas Perikanan dan Ilmu KelautanPasca Sarjana

Program Pasca Sarjana Universitas Negeri Gorontalo:

Program S2 Pendidikan Bahasa Inggris (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Kependudukan dan Lingkungan Hidup (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Matematika (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Dasar (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Biologi (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Fisika (Akreditasi B)Program S2 Administrasi Pendidikan (Akreditasi B)Program S2 Agribisnis (Akreditasi B)Program S2 Ilmu Kelautan dan Perikanan (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan (Akreditasi B)Program S2 Teknologi Pendidikan (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Ekonomi (Akreditasi B)Program S2 Ilmu Administrasi (Akreditasi B)Program S2 Ilmu Hukum (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Luar Sekolah (Akreditasi B)Program S2 Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (Akreditasi B)Program S3 Ilmu AdministrasiProgram S3 Ilmu PendidikanProgram S3 Pendidikan BahasaProgram S3 Pendidikan Ilmu Pengetahuan Alam