1. Program S2 Pendidikan Bahasa Inggris (Akreditasi B)
2. Program S2 Pendidikan Kependudukan dan Lingkungan Hidup (Akreditasi B)
3. Program S2 Pendidikan Matematika (Akreditasi B)
4. Program S2 Pendidikan Dasar (Akreditasi B)
5. Program S2 Pendidikan Biologi (Akreditasi B)
6. Program S2 Pendidikan Fisika (Akreditasi B)
7. Program S2 Administrasi Pendidikan (Akreditasi B)
8. Program S2 Agribisnis (Akreditasi B)
9. Program S2 Ilmu Kelautan dan Perikanan (Akreditasi B)
10. Program S2 Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan (Akreditasi B)
11. Program S2 Teknologi Pendidikan (Akreditasi B)
12. Program S2 Pendidikan Ekonomi (Akreditasi B)
13. Program S2 Ilmu Administrasi (Akreditasi B)
14. Program S2 Ilmu Hukum (Akreditasi B)
15. Program S2 Pendidikan Luar Sekolah (Akreditasi B)
16. Program S2 Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (Akreditasi B)
17. Program S3 Ilmu Administrasi
18. Program S3 Ilmu Pendidikan
19. Program S3 Pendidikan Bahasa
20. Program S3 Pendidikan Ilmu Pengetahuan Alam

Secara rinci nama pejabat pimpinan sejak tahun 1963 – sampai sekarang sbb :

1. Drs. Idris Djalali - Dekan Koordinator IKIP Yogyakarta Cab. Manado di Gorontalo - 1963-1966
2. Drs. Ek. M. J. Neno - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1967-1969
3. Prof. Drs. H. Thahir A. Musa - Dekan Koordinator IKIP Manado Cab. Gorontalo - 1969-1981
4. Prof. Drs. H. Kadir Abdussamad - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1982-1988
5. Drs. H. Husain Jusuf, M.Pd - Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1989-1992
6. Prof. Dr. H. Nani Tuloli
7. Dekan FKIP Unsrat Manado di Gorontalo - 1992-1993
8. Ketua STKIP Negeri Gorontalo - 1993 - 2001
9. Pj. Rektor IKIIP Negeri Gorontalo - 2001 - 2002
10. Prof. Dr. Ir. H. Nelson Pomalingo, M.Pd
11. Rektor IKIP Negeri Gorontalo - 2002-2004
12. Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2004-2010
13. Dr. H. Syamsu Qamar Badu, M.Pd - Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2010 - 2019
14. Dr. H. Eduart Wolok, ST, MT - Rektor Universitas Negeri Gorontalo - 2019 - 2023

Universitas Negeri Gorontalo (UNG) merupakan universitas yang dikembangkan atas dasar perluasan mandat (wider mandate) dari IKIP Negeri Gorontalo. Keberadaan Universitas Negeri Gorontalo dimulai dari Junior College FKIP Universitas Sulawesi Utara-Tengah (UNSULUTTENG) Manado di Gorontalo berdasarkan surat keputusan pejabat Rektor UNSULUTTENG Nomor 1313/II/E/63 tanggal 22 Juni 1963, Cabang FKIP UNSULUTTENG di Gorontalo berdasarkan Surat Keputusan Menteri PTIP nomor 67 tahun 1963 tanggal 11 Juli 1963, IKIP Manado Cabang Gorontalo berdasarkan Surat Keputusan Menteri PTIP Nomor 114 tahun 1965 tanggal 18 Juni 1965, FKIP UNSRAT Manado di Gorontalo berdasarkan Keppres nomor 70 tahun 1982 tanggal 7 September 1982, STKIP Gorontalo berdasarkan Kepres RI nomor 9 tahun 1993 tanggal 16 Januari 1993, IKIP Negeri Gorontalo berdasarkan Kepres RI nomor 19 tahun 2001 tanggal 5 Februari 2001.

Perubahan IKIP Negeri Gorontalo menjadi Universitas Negeri Gorontalo ditetapkan dengan surat Keputusan Presiden RI nomor 54 tahun 2004 tanggal 23 Juni 2004. Hari lahir UNG ditetapkan sama dengan lahirnya cabang FKIP UNSULUTTENG di Gorontalo yaitu, tanggal 1 September 1963 sebagaimana dinyatakan dalam surat keputusan menteri PTIP nomor 67 tahun 1963 tanggal 11 Juli 1963. Dalam perjalanannya selama 50 tahun telah mengalami tujuh kali pergantian pimpinan dan enam kali perubahan nama lembaga.