Prodi Agroteknologi mempunyai visi menjadi program studi terkemuka yang memiliki keunggulan IPTEK Pertanian sebagai implementasi keimanan dan ketaqwaan, dengan misi: (1) menyelenggarakan pendidikan bidang budidaya pertanian yang bertumpu pada kompetensi keilmuan dan teknologi; (2) menyelenggarakan penelitian dan pengembangan keilmuan dan teknologi bidang budidaya pertanian; (3) menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat yang bertumpu pada kompetensi keilmuan dan teknologi budidaya pertanian sebagai perujudan keimanan dan ketaqwaan; serta (4) mengintegrasikan dharma perguruan tinggi dalam pengembangan keilmuan dan teknologi budidaya pertanian. Prodi Agroteknologi bertujuan untuk menghasilkan lulusan yang memiliki kompetensi keilmuan dan teknologi budidaya pertanian yang kompetitif di pasar kerja serta memiliki kualitas iman dan taqwa dalam mengujudkan pertanian yang berkelanjutan berdasar pada kearifan lokal; dengan sasaran tercapainya kompetensi lulusan yang memiliki pengetahuan dam wawasan, serta memiliki kemampuan berpikir ilmiah, ketrampilan praktis, dan pengembangan diri.

Prodi Agroteknologi hadir untuk menjawab berbagai tantangan. Dengan motto “Save the Generation”, Prodi Agroteknologi mengarahkan pengembangan kompetensi pada internalisasi nilai-nilai keislaman dalam menerapkan ipteks pertanian dan pengelolaan sumber daya alam yang ramah lingkungan dan berbasis kearifan lokal, dengan penguatan bioteknologi dan berorientasi agroindustri. Untuk mendukung kompetensinya, Prodi Agroteknologi mengembangkan laboratorium bioteknologi, agroindustri, dan arsitektur lanskap serta produksi dan proteksi tanaman..