Universitas Gorontalo awalnya adalah sekolah tinggi ilmu Ekonomi Gorontalo, perguruan tinggi yang berada dibawah badan hukum yayasan pendidikan Duluwo Limo Lopahala Gorontalo. Pendirian Yayasan dan STIE Gorontalo diprakarsai oleh kol. Purn. H. Marten Liputo, SH (Bupati Gorontalo). STIE Gorontalo berdiri dengan SK Kopertis wilayah IX Nomor: 777 tahun 1986 tanggal 8 oktober 1986, menyelenggarakan dua jurusan yakni jurusan Manejemen dan Jurusan studi pembangunan. Jurusan  Manejemen STIE Gorontalo memperoleh status terdaftar pada tanggal 7 januari 1988 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor: 021/0/1988. Jurusan Manejemen kemudian memperoleh status diakui pada tanggal 14 agustus 1998 berdasarkan surat keputusan Direktorat Janderal Pendidikan Tinggi Nomor 302/Dikti/Kep/1998. Sedangkan Jurusan Studi Pembangunan berstatus sebagai terdaftar.

Pada akhir tahun 2000 Rencana Alih Status STIE menjadi Universitas Gorontalo telah dimulai dengan membentuk tim penyusun proposal Alih status yang di koordinir oleh Bambang Supriyanto dan beranggotakan antara lain; Hamzah Uno, Herman Paneo, Abdul Haris Panal, Abdu Jabar Mohidin,  dibantu oleh Haryono Imran. Mengingat perjuangan Alih status sangat sulit ditempu, Maka di bentuklah tim yang bekerja untuk mempersiapkan segala sesuatu yang dibutukan dalam proses tersebut.

Pada akhirnya, setelah melalui perjuangan panjang, usulan alih status STIE Gorontalo menjadi Universitas Gorontalo baru mendapatkan titik terang pada pertentang tahun 2001. Tepat tanggal 10 juli 2001 STIE Gorontalo resmi beralih status menjadi Universitas Gorontalo sebagaimana hal itu tertuang dalam ijin operasional Surat Keputusan Meteri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor : 80/D/0/2001. Untuk menyelenggarakan Universitas Gorontalo yang baru dilahirkan, maka ditunjuklah Rektor pertama Universitas Gorontalo, yakni Prof. Dr. H. JasinbTuloli, MPd.