Terdapat 20 program pasca sarjana universitas negeri Gorontalo, yaitu;

1. Program S2 Pendidikan Bahasa Inggris (Akreditasi B)

2. Program S2 Pendidikan Kependudukan dan Lingkungan Hidup (Akreditasi B)

3. Program S2 Pendidikan Matematika (Akreditasi B)

4. Program S2 Pendidikan Dasar (Akreditasi B)

5. Program S2 Pendidikan Biologi (Akreditasi B)

6. Program S2 Pendidikan Fisika (Akreditasi B)

7. Program S2 Administrasi Pendidikan (Akreditasi B)

8. Program S2 Agribisnis (Akreditasi B)

9. Program S2 Ilmu Kelautan dan Perikanan (Akreditasi B)

10. Program S2 Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan (Akreditasi B)

11. Program S2 Teknologi Pendidikan (Akreditasi B)

12.Program S2 Pendidikan Ekonomi (Akreditasi B)

13.Program S2 Ilmu Administrasi (Akreditasi B)

14. Program S2 Ilmu Hukum (Akreditasi B)

15. Program S2 Pendidikan Luar Sekolah (Akreditasi B)

16. Program S2 Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (Akreditasi B)

17. Program S3 Ilmu Administrasi

18. Program S3 Ilmu Pendidikan

19. Program S3 Pendidikan Bahasa

20. Program S3 Pendidikan Ilmu Pengetahuan Alam

Universitas Negeri Gorontalo memiliki 10 fakultas, yaitu:

1.Fakultas Ilmu Pendidikan

2.Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam

3.Fakultas Ilmu Sosia

l4.Fakultas Sastra dan Budaya

5.Fakultas Teknik

6.Fakultas Pertanian

7.Fakultas Ilmu Olahraga dan Kesehatan

8.Fakultas Ekonomi

9.Fakultas Hukum

10.Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan

Menurut industudent, pada tahun 2016 UNG termaksud 10 universitas terbaik di kawasan Indonesia Timur. Sedangkan untuk ditingkat Nasional UNG juga tidak kalah bersaing dan masuk dalam kategori 100 universitas terbaik. Berdasarkan data 4Internasional  Colleges and universitas tahun 2016 UNG menempati rangking 71 dari 411 universitas yang terdaftar resmi di Indonesia.